确定了迎战计划后，舰队开始清场，驱赶江面的花艇。高大的武毅级战舰甚至不需要用舰炮警示，直接撞过去，这些小小的花艇避之不及，赶紧划桨躲避。水手们在甲板上一边吆喝着让他们离开白鹅潭，一边笑吟吟倚在船舷俯视着艇上老鸨和姑娘们慌乱的模样。

在舰队的驱赶下，江面上的花艇一部分往西江上游躲避，一部分沿下游往黄埔港而去。

这边白鹅潭上舰队清场，那边广州城内也在积极备战。

海防参将许廷被总督亲自点名，委以火攻烧船的重任，干劲十足，召集水师将领商议，皆认为火攻可行：比起辽阔的海面，白鹅潭江面狭窄，贼人战船皆为帆船，难以机动躲避，只要许以重金派敢死之士操桨将船冲到贼船面前，贼船避无可避。

只是纵火船需要消耗很多船只，数量少了难以奏效，水师本身船只又严重不足，只好禀报上去，请总督解决。

王尊德此时只要能把贼人驱离白鹅潭，什么都好说。当即下了牌令，命令余葆成和南海、番禹两县县令在等各处钉封船只，不拘大小，一律送到黄埔港听用。

一时间江面上渔船、货船纷纷遭殃，刚刚从白鹅潭逃下来的花艇也不能幸免，不由分说的大批钉封到黄埔港。期间承办的官吏和水师将领们不免在其中舞弊，借着迎战的名义到处钉封。船主有钱有门路的，自然赶紧托人花钱疏通，将自己的船只赎回。没钱的百姓只能眼睁睁的看着自己的吃饭本钱被堆上柴草浇上菜油，准备付之一炬，捶胸顿足，很多花艇上的老鸨和姑娘没了去处，悲从中来，也是在岸边哭天喊地。

两天功夫，水师在黄埔港上集结了各种火攻船五十多艘，另外赶制了顺水流放漂的火筏一百多只。这些船只和火筏上全部装上了燃料，在船头加上固定的大铁钉。许廷在渔民和水师官兵中招募水性好的敢死之士，许诺每人先给十两银子安家费，活着回来的再给二十两，死了得也抚恤十两。优厚的条件顿时招募了三百多人，准备驾船去撞击贼人的船只。

同时，为了增强火势，这些船上还堆上了成桶的硫磺和火药，并加入了许多所谓的能产生毒烟的有毒药材。按照许廷的估计，这么多火攻船筏同时冲击，贼人再厉害也抵达不住。

许廷集中了余下的所有水师战船和征来临时充当战船的米艇、盐船40多艘，准备趁着火攻奏效，贼人大乱之际，乘势冲入敌阵，让水师官兵登船搏杀。赏格非常之高：斩贼人一人，赏十两；烧毁贼人战船一艘，赏一百两。